Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn1bP46414 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn1bP46414 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms