Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf1P46099 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf1P46099 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf1P46099 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf1P46099 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf1P46099 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf1P46099 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms