Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TfamP40630 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TfamP40630 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TfamP40630 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TfamP40630 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TfamP40630 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TfamP40630 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TfamP40630 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TfamP40630 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TfamP40630 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TfamP40630 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TfamP40630 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TfamP40630 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TfamP40630 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TfamP40630 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TfamP40630 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TfamP40630 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TfamP40630 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TfamP40630 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TfamP40630 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TfamP40630 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TfamP40630 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TfamP40630 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TfamP40630 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TfamP40630 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TfamP40630 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TfamP40630 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TfamP40630 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TfamP40630 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TfamP40630 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TfamP40630 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TfamP40630 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TfamP40630 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TfamP40630 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TfamP40630 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TfamP40630 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TfamP40630 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TfamP40630 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TfamP40630 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TfamP40630 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TfamP40630 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TfamP40630 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TfamP40630 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TfamP40630 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TfamP40630 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TfamP40630 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TfamP40630 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TfamP40630 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TfamP40630 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TfamP40630 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TfamP40630 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TfamP40630 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TfamP40630 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TfamP40630 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TfamP40630 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TfamP40630 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TfamP40630 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TfamP40630 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TfamP40630 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TfamP40630 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TfamP40630 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms