Protein–RNA interactions for Protein: P38647

Hspa9, Stress-70 protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa9P38647 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hspa9P38647 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hspa9P38647 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hspa9P38647 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms