Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Upk2P38575 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk2P38575 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk2P38575 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk2P38575 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Upk2P38575 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upk2P38575 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms