Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rom1P32958 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rom1P32958 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rom1P32958 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rom1P32958 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 250.5 ms