Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr1P30548 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tacr1P30548 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tacr1P30548 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms