Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm3P21107 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpm3P21107 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms