Protein–RNA interactions for Protein: P19788

Mgp, Matrix Gla protein, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MgpP19788 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MgpP19788 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MgpP19788 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MgpP19788 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MgpP19788 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MgpP19788 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MgpP19788 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MgpP19788 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MgpP19788 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MgpP19788 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MgpP19788 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MgpP19788 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MgpP19788 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MgpP19788 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MgpP19788 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MgpP19788 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MgpP19788 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MgpP19788 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MgpP19788 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MgpP19788 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MgpP19788 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MgpP19788 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MgpP19788 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MgpP19788 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MgpP19788 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MgpP19788 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MgpP19788 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MgpP19788 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms