Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Chrm1P12657 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrm1P12657 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms