Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FlgP11088 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FlgP11088 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FlgP11088 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FlgP11088 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FlgP11088 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FlgP11088 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FlgP11088 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FlgP11088 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FlgP11088 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FlgP11088 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FlgP11088 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FlgP11088 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FlgP11088 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FlgP11088 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FlgP11088 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FlgP11088 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FlgP11088 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FlgP11088 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FlgP11088 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FlgP11088 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FlgP11088 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FlgP11088 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FlgP11088 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FlgP11088 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FlgP11088 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FlgP11088 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FlgP11088 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FlgP11088 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FlgP11088 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FlgP11088 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FlgP11088 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FlgP11088 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FlgP11088 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FlgP11088 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FlgP11088 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FlgP11088 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FlgP11088 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FlgP11088 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FlgP11088 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FlgP11088 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FlgP11088 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FlgP11088 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FlgP11088 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FlgP11088 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FlgP11088 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FlgP11088 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FlgP11088 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FlgP11088 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FlgP11088 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FlgP11088 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FlgP11088 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FlgP11088 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FlgP11088 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FlgP11088 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FlgP11088 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FlgP11088 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FlgP11088 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FlgP11088 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FlgP11088 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FlgP11088 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FlgP11088 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FlgP11088 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FlgP11088 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FlgP11088 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FlgP11088 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FlgP11088 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FlgP11088 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FlgP11088 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FlgP11088 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FlgP11088 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FlgP11088 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FlgP11088 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FlgP11088 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FlgP11088 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FlgP11088 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FlgP11088 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FlgP11088 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FlgP11088 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FlgP11088 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FlgP11088 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FlgP11088 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FlgP11088 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FlgP11088 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FlgP11088 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FlgP11088 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FlgP11088 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FlgP11088 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FlgP11088 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FlgP11088 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FlgP11088 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FlgP11088 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FlgP11088 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FlgP11088 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FlgP11088 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FlgP11088 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FlgP11088 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FlgP11088 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FlgP11088 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FlgP11088 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms