Protein–RNA interactions for Protein: P01802

Ig heavy chain V-III region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01802 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01802 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01802 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01802 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01802 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01802 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01802 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01802 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01802 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01802 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01802 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01802 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01802 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01802 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01802 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01802 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01802 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01802 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01802 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01802 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01802 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01802 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01802 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01802 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01802 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01802 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01802 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01802 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01802 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01802 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01802 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01802 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01802 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01802 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01802 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01802 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01802 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01802 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01802 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01802 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01802 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01802 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01802 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01802 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01802 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01802 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01802 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01802 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01802 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01802 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01802 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01802 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01802 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01802 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01802 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms