Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp2O88554 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp2O88554 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp2O88554 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp2O88554 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp2O88554 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp2O88554 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Parp2O88554 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Parp2O88554 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Parp2O88554 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Parp2O88554 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Parp2O88554 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Parp2O88554 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp2O88554 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp2O88554 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp2O88554 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp2O88554 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp2O88554 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp2O88554 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp2O88554 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp2O88554 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp2O88554 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp2O88554 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms