Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm8356J3QPD3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8356J3QPD3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8356J3QPD3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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