Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20828J3KMI7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20828J3KMI7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms