Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8444F6XS56 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms