Protein–RNA interactions for Protein: F6PZL4

Gm15448, Predicted gene 15448, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15448F6PZL4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm15448F6PZL4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm15448F6PZL4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm15448F6PZL4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm15448F6PZL4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm15448F6PZL4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm15448F6PZL4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm15448F6PZL4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm15448F6PZL4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm15448F6PZL4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm15448F6PZL4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms