Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc141E9Q8Q6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc141E9Q8Q6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc141E9Q8Q6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms