Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1iE9Q7P2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1iE9Q7P2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms