Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm20425E9Q035 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm20425E9Q035 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20425E9Q035 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20425E9Q035 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20425E9Q035 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20425E9Q035 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20425E9Q035 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20425E9Q035 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20425E9Q035 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms