Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm4491E0CX42 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm4491E0CX42 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm4491E0CX42 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm4491E0CX42 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm4491E0CX42 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm4491E0CX42 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm4491E0CX42 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm4491E0CX42 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm4491E0CX42 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm4491E0CX42 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm4491E0CX42 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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