Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc13D3YV10 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc13D3YV10 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc13D3YV10 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms