Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud4B2RRE7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms