Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brpf1B2RRD7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brpf1B2RRD7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms