Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn7aB1AYL1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn7aB1AYL1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scn7aB1AYL1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms