Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdccag3A2AIW0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdccag3A2AIW0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms