Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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