Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tsc22d3Q9Z2S7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms