Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Knop1Q9Z2Q2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Knop1Q9Z2Q2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms