Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Arpc1bQ9WV32 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arpc1bQ9WV32 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms