Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpv2Q9WTR1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trpv2Q9WTR1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.6 ms