Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtsfQ9R013 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsfQ9R013 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsfQ9R013 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsfQ9R013 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtsfQ9R013 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtsfQ9R013 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsfQ9R013 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtsfQ9R013 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsfQ9R013 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms