Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN5

Prl3c1, Prolactin-3C1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3c1Q9QUN5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prl3c1Q9QUN5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prl3c1Q9QUN5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prl3c1Q9QUN5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 713.2 ms