Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col5a3Q9JLI2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col5a3Q9JLI2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col5a3Q9JLI2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms