Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms