Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl28Q9JIL2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl28Q9JIL2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms