Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ms4a4bQ9ES61 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ms4a4bQ9ES61 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ms4a4bQ9ES61 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ms4a4bQ9ES61 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ms4a4bQ9ES61 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ms4a4bQ9ES61 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a4bQ9ES61 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ms4a4bQ9ES61 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ms4a4bQ9ES61 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms