Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx6Q9ER75 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irx6Q9ER75 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms