Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stx12Q9ER00 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Stx12Q9ER00 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Stx12Q9ER00 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms