Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ubiad1Q9DC60 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubiad1Q9DC60 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms