Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc46a3Q9DC26 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc46a3Q9DC26 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms