Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Swt1Q9DBQ9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Swt1Q9DBQ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms