Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim23Q9DAL0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim23Q9DAL0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim23Q9DAL0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms