Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms