Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alkbh4Q9D8F1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Alkbh4Q9D8F1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms