Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pfn4Q9D6I3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pfn4Q9D6I3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms