Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrp2bpQ9D4C6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrp2bpQ9D4C6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms