Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fsip1Q9D3V5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fsip1Q9D3V5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fsip1Q9D3V5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms