Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D3J9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D3J9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9D3J9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9D3J9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D3J9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D3J9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D3J9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D3J9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D3J9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D3J9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms