Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkrip1Q9CWV6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms